Nei sistemi operativi Microsoft Windows che iniziano con Windows 95, il registro è un unico posto in cui conservare informazioni come quale hardware è collegato, quali opzioni di sistema sono state selezionate, come è impostata la memoria del computer e quali programmi applicativi devono essere presenti quando il sistema operativo viene avviato. Il registro è in qualche modo simile e sostituisce i più semplici file INI (inizializzazione) e di configurazione utilizzati nei precedenti sistemi Windows (basati su DOS). I file INI sono ancora supportati, tuttavia, per la compatibilità con le applicazioni a 16 bit scritte per i sistemi precedenti.
In generale, l'utente aggiorna il registro indirettamente utilizzando gli strumenti del Pannello di controllo, come TweakUI. Quando installi o disinstalli i programmi applicativi, vengono aggiornati anche il registro. In un ambiente di rete, le informazioni di registro possono essere conservate su un server in modo che i criteri di sistema per individui e gruppi di lavoro possano essere gestiti centralmente.