Un punteggio di rischio poligenico (PRS) è un'espressione della probabilità di qualcuno di avere o sviluppare una particolare condizione medica. È un metodo di previsione genomica che può essere calcolato valutando le informazioni su più marcatori genetici e varianti.
La pratica PRS è ancora in evoluzione e non è comunemente utilizzata dagli operatori sanitari. Non ci sono linee guida formali per il processo e i ricercatori stanno ancora lavorando per migliorare il modo in cui vengono generati i punteggi.
Tuttavia, l'uso di punteggi di rischio poligenico sta diventando sempre più popolare nelle discipline biomediche e delle scienze sociali. Anche le aziende sanitarie private e quelle dirette al consumatore, come la società di test genetici 23andMe, hanno commercializzato la pratica calcolando e vendendo PRS personali ai clienti.
I punteggi di rischio poligenico potrebbero potenzialmente diventare uno strumento importante per gli operatori sanitari. C'è la speranza che i PRS possano essere utilizzati per migliorare i risultati di salute accelerando le diagnosi, assistendo i fornitori nelle decisioni sanitarie e collegando i pazienti a trattamenti personalizzati.
Tuttavia, molti esperti di salute hanno delle riserve sull'utilità dei punteggi di rischio poligenico. Nel caso del diabete di tipo 2, ad esempio, il peso corporeo eccessivo può essere più altamente predittivo di un punteggio calcolato da dati genetici e le abitudini di salute possono avere più influenza sullo sviluppo della malattia rispetto al rischio ereditario.
Come viene utilizzato un punteggio di rischio poligenico?
La pratica di trovare punteggi di rischio poligenico è attualmente in evoluzione e le modalità di utilizzo dei punteggi per creare soluzioni attuabili ed economiche sono ancora in fase di definizione.
La pratica PRS può essere applicata efficacemente solo alle popolazioni che sono state coinvolte in studi genomici. Sfortunatamente, la maggior parte delle ricerche fino ad oggi ha valutato solo individui di discendenza europea. Di conseguenza, ci sono dati inadeguati sulle varianti genomiche di altre popolazioni e le loro PRS non possono essere facilmente calcolate.
Inoltre, alcune ricerche hanno presentato incertezza etica riguardo al modo in cui potrebbero essere utilizzati i punteggi di rischio poligenico, ad esempio la stima del successo accademico. C'è anche preoccupazione su come vengono interpretate le informazioni complesse e talvolta ambigue prodotte dagli studi sulla PRS.
Tuttavia, determinare la predisposizione di una persona alla malattia offre importanti vantaggi. Ad esempio, le donne negli Stati Uniti attualmente iniziano il regime di screening del cancro al seno all'età di 50 anni. Se le donne più giovani possono scoprire presto il loro alto rischio di cancro al seno, allora possono iniziare il regime di screening prima e possibilmente migliorare i loro risultati futuri.
Se i pazienti scoprono di essere a rischio di una malattia incurabile, come il morbo di Alzheimer, i loro PRS possono essere utilizzati per abbinarli a studi clinici e farmaci che potrebbero essere utili.
I punteggi di rischio poligenico hanno anche una varietà di potenziali usi se associati ad altre misure di rischio esistenti e complementari. Ad esempio, uno studio del 2013 condotto da Samuli Ripatti presso l'Università di Helsinki ha scoperto che la combinazione di PRS con altri fattori di rischio convenzionali per la malattia coronarica - come l'ipertensione e / o l'indice di massa corporea - ha fatto avanzare le previsioni dei pazienti che lo avrebbero fatto. sviluppare la malattia. Lo studio ha rivelato che la combinazione di pratiche potrebbe identificare un gruppo di individui ad alto rischio che altrimenti sarebbero stati considerati a rischio intermedio.
Come calcolare un punteggio di rischio poligenico
Esistono diversi metodi per calcolare il PRS; tuttavia, un punteggio di rischio poligenico viene generalmente calcolato analizzando più SNP contemporaneamente. SNP - pronunciato snip - sta per polimorfismo a singolo nucleotide. I nucleotidi sono i mattoni del DNA; ci sono quattro tipi: adenina (A), timina (T), citosina (C) o guanina (G).
Un SNP è una variazione della sequenza del DNA che si verifica quando un singolo nucleotide nel genoma differisce da altri cromosomi accoppiati nell'individuo o da altri membri della stessa specie. Il genoma è l'intero materiale genetico di un organismo. I ricercatori possono prendere queste informazioni, inserirle in un computer e utilizzare le statistiche per prevedere come gli SNP totali di un individuo contribuiscono al rischio di malattia.
I ricercatori sono stati in grado di identificare varianti genomiche associate a malattie confrontando la composizione genetica di individui con e senza malattie specifiche. Possono esserci centinaia, se non migliaia, di varianti per ogni malattia, ma la grande quantità di dati genomici disponibili ha permesso ai ricercatori di calcolare quali varianti sono più comuni nei gruppi di persone con una malattia e aumentare la previsione del rischio.
Come interpretare un punteggio di rischio poligenico
I punteggi del rischio poligenico rivelano il rischio relativo di una persona per una malattia. È relativo perché i dati utilizzati per generare il PRS provengono da studi genomici su larga scala che confrontano gruppi di persone con la malattia a gruppi senza. In altre parole, un punteggio di rischio poligenico dirà a un individuo come il suo rischio si confronta con quello di una persona con un diverso corredo genetico.
Un PRS non rivelerà una linea di base o una linea temporale per la progressione di una malattia. Inoltre, un alto punteggio di rischio poligenico non garantisce che un individuo svilupperà la malattia; identifica semplicemente che l'individuo ha una maggiore responsabilità genetica - o probabilità - di ammalarsi e dovrebbe indagare su misure preventive.
I punteggi di rischio poligenico possono essere visualizzati su una curva a campana. La maggior parte delle persone avrà punteggi al centro della curva; questo rappresenta un livello di rischio medio per lo sviluppo di una specifica malattia. Altre persone avranno punteggi alle estremità della coda. I punteggi all'estremità sinistra indicano un rischio basso, mentre i punteggi all'estremità destra indicano un rischio elevato e che gli individui dovrebbero rispondere con soluzioni preventive.
Questa immagine mostra come i punteggi di rischio poligenico possono essere mappati su una curva a campana, con un rischio basso a un'estremità e un rischio elevato all'altra.
Punteggio di rischio poligenico e 23andMe
Alla conferenza SXSW del 2019, 23andMe ha annunciato che avrebbe fornito un'analisi del rischio basata sulla genetica per il diabete di tipo 2 a milioni di clienti. L'azienda mette in correlazione le informazioni genetiche degli individui con i dati relativi alla salute; i dati risultanti supportano la costruzione di modelli statistici che possono produrre un punteggio di rischio poligenico e prevedere la probabilità di vari tratti e condizioni dal DNA di un individuo.
Secondo il comunicato stampa dell'azienda, al 20% dei clienti verrebbe detto che il loro rischio è superiore alla media; quelli nella categoria ad alto rischio avrebbero quantificato i loro punteggi, come in una possibilità su tre di sviluppare la malattia. Questi clienti sarebbero anche presi di mira con il marketing per un'app di monitoraggio della salute di Lark, un partner di 23andMe.